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卓越平台 | 發掘蛋白(bái)可開(kāi)發性的寶藏路徑:in-silico預測與表征驗證

發布日期:2023-06-19

藥物(wù)可開(kāi)發性研究是一(yī)種風險評估和風險緩解措施,旨在将候選物(wù)高概率地開(kāi)發成臨床醫學中(zhōng)可用的藥物(wù)。在此開(kāi)發過程中(zhōng),為了高效低成本篩選出低風險候選分(fēn)子進入CMC開(kāi)發階段,可以利用多信息平台In-silico預測分(fēn)析,以極低的成本獲取靶蛋白(bái)結構、物(wù)理、化學性質和潛在風險信息,設計針對性的表征實驗加以驗證,确保以合理的成本和時間線内順利通過化學、生(shēng)産和控制流程(CMC)。

本文将簡單展示行業内通用可開(kāi)發性策略,結合漢騰生(shēng)物(wù)in-silico分(fēn)析平台,對創新蛋白(bái)分(fēn)子可開(kāi)發性評估中(zhōng)的具體(tǐ)工(gōng)作梳理一(yī)些思路。

In-silico預測數據全流程支持藥物(wù)可開(kāi)發性研究

In-silico使用分(fēn)子信息學對候選分(fēn)子的物(wù)理化學屬性、結構、聚集傾向、翻譯後修飾、穩定性和免疫原性的預測信息,能夠有效對候選藥物(wù)分(fēn)子進行排序,篩選,定向優化改造,提供潛在風險的早期提示,幫助我(wǒ)(wǒ)們及時調整開(kāi)發策略,如調整上下(xià)遊工(gōng)藝和制劑配方開(kāi)發,以解決潛在問題。



In-silico分(fēn)析助力分(fēn)子篩選和優化

In-silico分(fēn)析基本流程

基于序列分(fēn)析和3D空間結構測量,能夠獲得蛋白(bái)分(fēn)子量、等電(diàn)點、消光系數、二硫鍵、遊離(lí)巯基、糖基化等信息,進一(yī)步對潛在風險翻譯後修飾、分(fēn)子完整性、聚集性、疏水性等屬性進行預測。3D可視化能夠加深對功能位點和作用機制的深刻理解,結合平台經驗,進行風險識别和應對策略評估,此外(wài)結構和分(fēn)子背景的全面科學理解,對上下(xià)遊工(gōng)藝,分(fēn)析方法,制劑開(kāi)發能提供有力參考。



漢騰生(shēng)物(wù)in-silico分(fēn)析流程



漢騰生(shēng)物(wù)in-silico常用工(gōng)具

表征驗證平台
漢騰理化分(fēn)析和生(shēng)化分(fēn)析平台具備成熟的藥物(wù)可開(kāi)發性研究策略和分(fēn)析評估經驗,利用in-silico對候選物(wù)的屬性預測,針對性設計關鍵表征分(fēn)析實驗,能夠低成本、高效率以及高準确度地對候選分(fēn)子的可開(kāi)發性潛力進行評估。


漢騰生(shēng)物(wù)in-silico數據驗證方案

IgM 開(kāi)發實例
IgM是人體(tǐ)第一(yī)道天然免疫屏障中(zhōng)關鍵的免疫球蛋白(bái),能夠結合補體(tǐ),殺菌,溶菌,中(zhōng)和病毒對抗病原體(tǐ)入侵。天然IgM分(fēn)子量巨大(dà),血清中(zhōng)以900KD大(dà)小(xiǎo)的五聚體(tǐ)形式存在,具有重組表達量低,溶解度低,穩定性差等曆史難題,但漢騰生(shēng)物(wù)IgMax平台成功克服以上困難,已協助多個客戶完成IND研究。

在此之前漢騰分(fēn)析團隊對已對IgM的聚集體(tǐ)形式、二硫鍵、遊離(lí)巯基、氨基酸序列、翻譯後修飾、N-糖基化位點、假病毒中(zhōng)和活性等進行in-silico預測和全面的表征驗證工(gōng)作,獲得其五聚體(tǐ)含J鍊的構型、98對二硫鍵、2個遊離(lí)巯基、51個N-糖位點、各位點優勢糖型和空間功能的全面屬性揭示。大(dà)大(dà)加快了IgM在生(shēng)物(wù)制藥領域的應用進度。


IgM模式圖




in-silico自由巯基的3D預測和表征驗證方案

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